Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms