Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N5

RBM27, RNA-binding protein 27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM27Q9P2N5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM27Q9P2N5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RBM27Q9P2N5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RBM27Q9P2N5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM27Q9P2N5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM27Q9P2N5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM27Q9P2N5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM27Q9P2N5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM27Q9P2N5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM27Q9P2N5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM27Q9P2N5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM27Q9P2N5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM27Q9P2N5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM27Q9P2N5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM27Q9P2N5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM27Q9P2N5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM27Q9P2N5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM27Q9P2N5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM27Q9P2N5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM27Q9P2N5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM27Q9P2N5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM27Q9P2N5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM27Q9P2N5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM27Q9P2N5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM27Q9P2N5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM27Q9P2N5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM27Q9P2N5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM27Q9P2N5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM27Q9P2N5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM27Q9P2N5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM27Q9P2N5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM27Q9P2N5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM27Q9P2N5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM27Q9P2N5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM27Q9P2N5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM27Q9P2N5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM27Q9P2N5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM27Q9P2N5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms