Protein–RNA interactions for Protein: Q9P109

GCNT4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT4Q9P109 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNT4Q9P109 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNT4Q9P109 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNT4Q9P109 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNT4Q9P109 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNT4Q9P109 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNT4Q9P109 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNT4Q9P109 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNT4Q9P109 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNT4Q9P109 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNT4Q9P109 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT4Q9P109 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT4Q9P109 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT4Q9P109 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT4Q9P109 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT4Q9P109 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT4Q9P109 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT4Q9P109 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT4Q9P109 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT4Q9P109 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT4Q9P109 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT4Q9P109 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT4Q9P109 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT4Q9P109 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT4Q9P109 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT4Q9P109 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT4Q9P109 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT4Q9P109 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNT4Q9P109 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GCNT4Q9P109 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT4Q9P109 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms