Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAPAQ9P0L0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAPAQ9P0L0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms