Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC59Q9P031 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC59Q9P031 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms