Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL5

CYP39A1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP39A1Q9NYL5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP39A1Q9NYL5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP39A1Q9NYL5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP39A1Q9NYL5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP39A1Q9NYL5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP39A1Q9NYL5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP39A1Q9NYL5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP39A1Q9NYL5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP39A1Q9NYL5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms