Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFT57Q9NWB7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFT57Q9NWB7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFT57Q9NWB7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFT57Q9NWB7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFT57Q9NWB7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFT57Q9NWB7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFT57Q9NWB7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
IFT57Q9NWB7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
IFT57Q9NWB7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
IFT57Q9NWB7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFT57Q9NWB7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
IFT57Q9NWB7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
IFT57Q9NWB7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFT57Q9NWB7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFT57Q9NWB7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFT57Q9NWB7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms