Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms