Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXD4L1Q9NU39 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms