Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB4Q9NTQ9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB4Q9NTQ9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms