Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HOMER2Q9NSB8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms