Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNBIP1Q9NSA3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNBIP1Q9NSA3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms