Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TM7SF3Q9NS93 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TM7SF3Q9NS93 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms