Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR1

CYTL1, Cytokine-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTL1Q9NRR1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CYTL1Q9NRR1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTL1Q9NRR1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTL1Q9NRR1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTL1Q9NRR1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTL1Q9NRR1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTL1Q9NRR1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTL1Q9NRR1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTL1Q9NRR1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTL1Q9NRR1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms