Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNRC6CQ9HCJ0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms