Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ELL3Q9HB65 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms