Protein–RNA interactions for Protein: Q9H422

HIPK3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK3Q9H422 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HIPK3Q9H422 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms