Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF541Q9H0D2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms