Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZQ3

COMMD5, COMM domain-containing protein 5, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD5Q9GZQ3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COMMD5Q9GZQ3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COMMD5Q9GZQ3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COMMD5Q9GZQ3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COMMD5Q9GZQ3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COMMD5Q9GZQ3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COMMD5Q9GZQ3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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