Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms