Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM3Q9BZL3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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