Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms