Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms