Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY49

PECR, Peroxisomal trans-2-enoyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PECRQ9BY49 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PECRQ9BY49 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PECRQ9BY49 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PECRQ9BY49 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PECRQ9BY49 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PECRQ9BY49 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PECRQ9BY49 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PECRQ9BY49 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PECRQ9BY49 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PECRQ9BY49 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PECRQ9BY49 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PECRQ9BY49 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PECRQ9BY49 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PECRQ9BY49 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PECRQ9BY49 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PECRQ9BY49 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PECRQ9BY49 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PECRQ9BY49 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PECRQ9BY49 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PECRQ9BY49 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PECRQ9BY49 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PECRQ9BY49 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PECRQ9BY49 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PECRQ9BY49 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PECRQ9BY49 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PECRQ9BY49 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PECRQ9BY49 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PECRQ9BY49 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PECRQ9BY49 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PECRQ9BY49 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PECRQ9BY49 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PECRQ9BY49 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms