Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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