Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BRIP1Q9BX63 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRIP1Q9BX63 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms