Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF2

TRAIP, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAIPQ9BWF2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAIPQ9BWF2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAIPQ9BWF2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAIPQ9BWF2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAIPQ9BWF2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAIPQ9BWF2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAIPQ9BWF2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAIPQ9BWF2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAIPQ9BWF2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAIPQ9BWF2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAIPQ9BWF2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAIPQ9BWF2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAIPQ9BWF2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAIPQ9BWF2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAIPQ9BWF2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAIPQ9BWF2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAIPQ9BWF2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAIPQ9BWF2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAIPQ9BWF2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAIPQ9BWF2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAIPQ9BWF2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAIPQ9BWF2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAIPQ9BWF2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAIPQ9BWF2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAIPQ9BWF2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAIPQ9BWF2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAIPQ9BWF2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms