Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NUP58Q9BVL2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP58Q9BVL2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms