Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU40

CHRDL1, Chordin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDL1Q9BU40 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRDL1Q9BU40 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRDL1Q9BU40 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRDL1Q9BU40 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRDL1Q9BU40 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRDL1Q9BU40 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRDL1Q9BU40 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRDL1Q9BU40 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRDL1Q9BU40 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRDL1Q9BU40 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRDL1Q9BU40 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRDL1Q9BU40 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRDL1Q9BU40 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRDL1Q9BU40 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRDL1Q9BU40 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRDL1Q9BU40 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms