Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
RBM42Q9BTD8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms