Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LPIN3Q9BQK8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms