Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SGIP1Q9BQI5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms