Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQB6

VKORC1, Vitamin K epoxide reductase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VKORC1Q9BQB6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VKORC1Q9BQB6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VKORC1Q9BQB6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VKORC1Q9BQB6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VKORC1Q9BQB6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VKORC1Q9BQB6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VKORC1Q9BQB6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VKORC1Q9BQB6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VKORC1Q9BQB6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VKORC1Q9BQB6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VKORC1Q9BQB6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VKORC1Q9BQB6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VKORC1Q9BQB6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VKORC1Q9BQB6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VKORC1Q9BQB6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VKORC1Q9BQB6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VKORC1Q9BQB6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VKORC1Q9BQB6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VKORC1Q9BQB6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VKORC1Q9BQB6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VKORC1Q9BQB6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VKORC1Q9BQB6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VKORC1Q9BQB6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VKORC1Q9BQB6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VKORC1Q9BQB6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VKORC1Q9BQB6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VKORC1Q9BQB6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VKORC1Q9BQB6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VKORC1Q9BQB6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VKORC1Q9BQB6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VKORC1Q9BQB6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VKORC1Q9BQB6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VKORC1Q9BQB6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VKORC1Q9BQB6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VKORC1Q9BQB6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VKORC1Q9BQB6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VKORC1Q9BQB6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VKORC1Q9BQB6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VKORC1Q9BQB6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VKORC1Q9BQB6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VKORC1Q9BQB6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VKORC1Q9BQB6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VKORC1Q9BQB6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VKORC1Q9BQB6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VKORC1Q9BQB6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VKORC1Q9BQB6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VKORC1Q9BQB6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VKORC1Q9BQB6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms