Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MYD88Q99836 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYD88Q99836 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYD88Q99836 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYD88Q99836 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYD88Q99836 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYD88Q99836 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYD88Q99836 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYD88Q99836 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYD88Q99836 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYD88Q99836 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYD88Q99836 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYD88Q99836 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYD88Q99836 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYD88Q99836 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYD88Q99836 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYD88Q99836 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYD88Q99836 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYD88Q99836 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYD88Q99836 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYD88Q99836 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYD88Q99836 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYD88Q99836 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYD88Q99836 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYD88Q99836 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYD88Q99836 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYD88Q99836 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYD88Q99836 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
MYD88Q99836 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYD88Q99836 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYD88Q99836 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYD88Q99836 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYD88Q99836 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MYD88Q99836 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms