Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RBBP8Q99708 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms