Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PSMD1Q99460 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMD1Q99460 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms