Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRAMP1Q96RY5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CRAMP1Q96RY5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms