Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC85AQ96PX6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC85AQ96PX6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms