Protein–RNA interactions for Protein: Q96P50

ACAP3, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP3Q96P50 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACAP3Q96P50 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACAP3Q96P50 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACAP3Q96P50 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ACAP3Q96P50 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACAP3Q96P50 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ACAP3Q96P50 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACAP3Q96P50 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACAP3Q96P50 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ACAP3Q96P50 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACAP3Q96P50 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACAP3Q96P50 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACAP3Q96P50 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACAP3Q96P50 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACAP3Q96P50 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACAP3Q96P50 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACAP3Q96P50 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACAP3Q96P50 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACAP3Q96P50 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACAP3Q96P50 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACAP3Q96P50 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACAP3Q96P50 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACAP3Q96P50 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACAP3Q96P50 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACAP3Q96P50 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACAP3Q96P50 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACAP3Q96P50 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACAP3Q96P50 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACAP3Q96P50 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACAP3Q96P50 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACAP3Q96P50 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACAP3Q96P50 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACAP3Q96P50 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACAP3Q96P50 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACAP3Q96P50 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACAP3Q96P50 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACAP3Q96P50 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACAP3Q96P50 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACAP3Q96P50 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACAP3Q96P50 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACAP3Q96P50 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACAP3Q96P50 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACAP3Q96P50 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACAP3Q96P50 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACAP3Q96P50 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACAP3Q96P50 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACAP3Q96P50 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACAP3Q96P50 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACAP3Q96P50 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACAP3Q96P50 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACAP3Q96P50 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms