Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms