Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
EP400Q96L91 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EP400Q96L91 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms