Protein–RNA interactions for Protein: Q96JP9

CDHR1, Cadherin-related family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR1Q96JP9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDHR1Q96JP9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDHR1Q96JP9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDHR1Q96JP9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDHR1Q96JP9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDHR1Q96JP9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR1Q96JP9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms