Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD0

PDXP, Pyridoxal phosphate phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDXPQ96GD0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDXPQ96GD0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDXPQ96GD0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDXPQ96GD0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDXPQ96GD0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDXPQ96GD0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDXPQ96GD0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDXPQ96GD0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDXPQ96GD0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDXPQ96GD0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDXPQ96GD0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDXPQ96GD0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDXPQ96GD0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDXPQ96GD0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDXPQ96GD0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDXPQ96GD0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDXPQ96GD0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDXPQ96GD0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PDXPQ96GD0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDXPQ96GD0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDXPQ96GD0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms