Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ELP4Q96EB1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ELP4Q96EB1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ELP4Q96EB1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ELP4Q96EB1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ELP4Q96EB1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ELP4Q96EB1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ELP4Q96EB1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ELP4Q96EB1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ELP4Q96EB1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ELP4Q96EB1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ELP4Q96EB1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ELP4Q96EB1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ELP4Q96EB1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ELP4Q96EB1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ELP4Q96EB1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms