Protein–RNA interactions for Protein: Q96E40

SPACA9, Sperm acrosome-associated protein 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA9Q96E40 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPACA9Q96E40 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPACA9Q96E40 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPACA9Q96E40 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPACA9Q96E40 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPACA9Q96E40 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPACA9Q96E40 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPACA9Q96E40 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPACA9Q96E40 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPACA9Q96E40 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPACA9Q96E40 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPACA9Q96E40 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPACA9Q96E40 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPACA9Q96E40 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPACA9Q96E40 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPACA9Q96E40 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPACA9Q96E40 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SPACA9Q96E40 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPACA9Q96E40 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPACA9Q96E40 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPACA9Q96E40 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPACA9Q96E40 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPACA9Q96E40 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPACA9Q96E40 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPACA9Q96E40 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPACA9Q96E40 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPACA9Q96E40 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPACA9Q96E40 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPACA9Q96E40 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPACA9Q96E40 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SPACA9Q96E40 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SPACA9Q96E40 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPACA9Q96E40 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPACA9Q96E40 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPACA9Q96E40 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPACA9Q96E40 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPACA9Q96E40 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms