Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG2BQ96BY7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms