Protein–RNA interactions for Protein: Q96B97

SH3KBP1, SH3 domain-containing kinase-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3KBP1Q96B97 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3KBP1Q96B97 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3KBP1Q96B97 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3KBP1Q96B97 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3KBP1Q96B97 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3KBP1Q96B97 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3KBP1Q96B97 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3KBP1Q96B97 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3KBP1Q96B97 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3KBP1Q96B97 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3KBP1Q96B97 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3KBP1Q96B97 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3KBP1Q96B97 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3KBP1Q96B97 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3KBP1Q96B97 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3KBP1Q96B97 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3KBP1Q96B97 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3KBP1Q96B97 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3KBP1Q96B97 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3KBP1Q96B97 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3KBP1Q96B97 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3KBP1Q96B97 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3KBP1Q96B97 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3KBP1Q96B97 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3KBP1Q96B97 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3KBP1Q96B97 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3KBP1Q96B97 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3KBP1Q96B97 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3KBP1Q96B97 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3KBP1Q96B97 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3KBP1Q96B97 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3KBP1Q96B97 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SH3KBP1Q96B97 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SH3KBP1Q96B97 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SH3KBP1Q96B97 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3KBP1Q96B97 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms