Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RFT1Q96AA3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms