Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RFKQ969G6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms