Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms